Настраиваем Glassfish 3.2 на использование логгера log4j

1. Качаем log4j jar. 
2. Копируем его в директорию Glassfish /lib. 
3. Создаем файл настроек log4j.properties и кладем его в директорию /config домена (например, GLASSFISH_HOME/domains/domain1/config/) 
4. Добавляем опцию JVM Dlog4j.configuration=file:///${com.sun.aas.instanceRoot}/config/log4j.properties 
5. Перезапускаем Glassfish 
6. Profit!!!